蛋白质飞行质谱检测即基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（MALDITOF）检测，该方法最大的特点在于使用基质辅助的软电离技术将蛋白质/肽段电离成离子。基质在MALDI中担负着关键的角色，它不仅可以吸收激光的能量并传递到蛋白质/肽段样品中，还能保护待测样品不受破坏而形成碎片离子。因此，在蛋白质MALDITOF质谱分析中，首先要制备基质包埋的蛋白质样品，通常是将基质的饱和溶液与待检测的蛋白样品溶液混合，再将0.5-1ul左右的混合液加载到样品板上，待溶剂挥发干后形成蛋白样品和基质的混晶，即可引入质谱分析。对于蛋白质、多肽、核酸或多糖类样品，较为通用的基质有芥子酸、2，5-羟基苯甲酸、3-羟基吡啶甲酸、α-氰基-4-羟肉桂酸等。